中证500期货长期贴水的主要原因包括以下几点：

1. 流动性不足：中证500指数成分股较多，部分股票流动性较低，导致期货市场交易量不足，买卖双方难以达成一致价格，使得期货合约价格偏离现货指数价格。

2. 风险溢价：由于中证500指数涵盖了大量中小市值股票，相比于主流指数如上证50指数，中证500指数的风险更高。投资者对于高风险资产要求更高的回报，因此中证500期货价格常常贴水。

3. 市场预期：投资者对于中证500指数未来走势持谨慎态度，认为指数可能会下跌，因此愿意以低于现货指数价格的价格交易中证500期货。

4. 套利机会有限：由于中证500期货价格长期贴水，套利空间受到限制，使得市场上套利者数量有限，无法有效拉近期货与现货价格差。

综上所述，中证500期货长期贴水的原因主要是由于流动性不足、风险溢价、市场预期和套利机会有限等因素共同作用所致。